遺伝子名とその始点 遺伝子の始点と終点 エクソンの始点と終点 SNPの位置 SNPの位置とアソシエーション強度 ペアワイズLDの第1点SNPの位置と第2点SNPの位置とそのLDインデックス値 ブロックの位置とそのハプロタイプ頻度 ボックスはブランクのままでも構いませんが、 データ以外の文字等は入力しないでください。 試しに実行する場合も、説明文を消去しないと描図されませんのでご注意ください このボックスには遺伝子名とその始点塩基番号をスペースまたはタブ区切りで入力してください。 １遺伝子１行です。 genea 100 geneb 200 genec 500 このボックスには遺伝子の始点と終点の塩基番号と終止塩基番号をスペースまたはタブ区切りで入力してください。１遺伝子1行です。左隣のボックスと合わなくてもかまいません。 100 150 200 342 500 758 このボックスには、エクソンの始点塩基番号と終点塩基番号をスペースまたはタブ区切りで入力してください。１エクソン1行です。 100 102 122 129 132 137 140 150 200 220 250 303 323 342 500 520 712 758 このボックスにはSNPの塩基番号を入力してください。 １SNP１行です。 143 204 243 300 421 591 793 このボックスには、SNPに認められた検定値などを入れてください。 最大値10ですので、適宜入力値を加減してください。１SNP１行です。 143 1.3 204 0.3 243 2 300 5.1 421 3.2 591 1.1 793 0.2 このボックスはハプロタイプの位置とその頻度をケース・コントロール別に表示するための情報を入力します。 セグメントの始点・終点塩基番号とそのセグメントに認められたハプロタイプの頻度を0-1の数値で、ケース先、コントロール後で入力してください。スペースまたはタブ区切り、１ハプロタイプ１行です。 143 300 0.6 0.1 143 300 0.35 0.2 143 300 0.05 0.5 591 793 0.5 0 591 793 0.2 0 591 790 0.2 0.3 ペアワイズLDインデックス値を入力するボックスです。 片側のSNPの塩基番号、もう片側のSNPの塩基番号、LD index値(0-1) をスペースまたはタブ区切りで入力してください。 １ペア１行です。 143 204 0.9 143 243 0.4 143 300 0.2 143 421 0.24 143 591 0.3 143 793 0.2 204 243 0.7 204 300 0.9 204 421 0.4 204 591 0.4 204 793 0.1 243 300 0.75 243 421 0.66 243 591 0.3 243 793 0.3 300 421 0.8 300 591 0.43 300 793 0.1 421 591 0.5 421 793 0.2 691 793 0.5
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